Микрофлора тела человека играет важную роль в поддержании здоровья. На протяжении всей жизни на ее состав влияет ряд физиологических и социальных факторов. 

Первые микроорганизмы начинают заселять тело новорожденного еще при прохождении родовых путей матери во время родов. В последующем микробное сообщество сохраняется в организме, увеличивая биологическое разнообразие и изменяя видовой и количественный состав микробной флоры. Совместная жизнь человеческого организма с бактериями оказывает колоссальное влияние на состояние здоровья. 

В норме микрофолора ротоглотки играет защитную роль и является так называемым фильтром, который противодействует заселению организма болезнетворными бактериями.

Микрофлора зева — главным образом бактерии, вирусы и грибы — включает в себя нормальную резидентную флору, которая присутствует в течение всей жизни и быстро восстанавливается в случае нарушения, и транзиторную флору, которая может колонизировать слизистую оболочку ротоглотки в течение нескольких часов или недель, но не сохраняется на более длительный период. 

Количественный и качественный состав нормальной микрофлоры зева достаточно стабилен и включает: стрептококки, сапрофитные нейсерии, лактобактерии, стафилококки, дифтероиды, пептострептококки, бактероиды, коринебактерии, фузобактерии, актиномицеты. 

Под воздействием внешних факторов (переохлаждение, травмы) или если иммунитет человека ослаблен по другой причине, представители условно-патогенной микрофлоры ротоглотки могут проявить свои патогенные свойства и стать причиной развития инфекционных заболеваний верхних дыхательных путей. 

Инфекции верхних дыхательных путей распространены среди людей всех возрастов. Заражение ими возможно в любое время, но пик заболеваемости обычно приходится на осенне-зимний период. В данную группу входят следующие заболевания:

1. Ринит — воспаление слизистой оболочки носа;
2. Фарингит — воспаление глотки;
3. Тонзиллит — воспаление глоточных и небных миндалин;
4. Ларингит — воспаление гортани. 

Инфекции верхних дыхательных путей, как правило, проявляются следующими типичными клиническими симптомами:

1. Насморк, заложенность носа;
2. Боли в горле;
3. Чихание;
4. Кашель;
5. Головная боль;
6. Повышение температуры тела; 
7. Общее недомогание;
8. Боли в мышцах.

У пациентов с острым воспалением ротоглотки важными задачами являются установление точного диагноза и назначение адекватной терапии. Вероятность ошибки при дифференциальной диагностике данных заболеваний высока именно из-за сходства клинических проявлений при вирусном и бактериальном генезе заболевания. 

Посев отделяемого из зева является стандартом диагностики инфекций верхних дыхательных путей, подтверждающим или опровергающим роль бактерий в развитии данных заболеваний. 

После выявления возбудителя инфекции проводят исследование его чувствительности к антибактериальным препаратам (антибиотикам) и бактериофагам — лекарственным препаратам, которые представляют собой вирусы, избирательно поражающие бактерий и тем самым ограничивающие рост и размножение последних.

Этот этап особенно важен при выборе лекарственного препарата для терапии инфекционного заболевания, потому как позволяет избежать распространения инфекции и ее осложнений у конкретного пациента.