Анализ полиморфизмов в генах INS, PPAR-y, CYP11a, AR — анализ наличия основных мутаций. Результаты исследования позволяют выявить причину развития данной патологии и назначить своевременное лечение.
Генетическое исследование проводится по 4 генам:

• Ген инсулина (INS)
• Ген PPARy2
• Ген CYP11A
• Ген рецептора андрогенов (AR)

Трудности диагностики связаны с тем, что функции яичников, надпочечников, гипоталамуса и гипофиза тесно переплетены друг с другом, и поражение любого из этих отделов половой системы не может не оказывать влияния на состояние других её звеньев и в итоге — на функциональное состояние репродуктивной системы в целом.
Ген INS (проинсулин)
Кодирует профермент, который синтезируется бета-клетками островков Лангерганца поджелудочной железы и клетками тимуса. Проинсулин энзиматически превращается в A- и В-цепи инсулина и С-пептид, а зрелый инсулин при связывании с рецептором, в свою очередь, стимулирует утилизацию глюкозы мышцами и печенью и снижает уровень глюкозы в крови. При экспрессии в тимусе инсулин регулирует негативную селекцию аутореактивных Т-клеток и определяет иммунную толерантность в отношении бета-клеток ПЖЖ.
Ген PPARγ2
Располагается на коротком плече третьей хромосомы (3p25) и кодирует рецептор, активирующий пролиферацию пероксисом (РАПП). РАПП регулирует энергетический, жировой и углеводный обмен. Повышение его активности предрасполагает к развитию ИР и, как следствие, ГИ.
Ген CYP11А 
Расположен на длинном плече 15-й хромосомы (участок 15q24), кодирует фермент, отщепляющий боковую цепь и лимитирует скорость реакции образования прегненолона из холестерина в яичниках и надпочечниках. Повышенная активность данного гена была отмечена при наличии определенных нуклеотидных последовательностей в его промоторной области.
Одним из двух основных вариантов полиморфизма промоторной области гена CYP11A является наличие разного количества пентануклеотидных повторов TTTTA, начиная с позиции 528. Основными вариантами, наблюдаемыми в популяции являются варианты 216R, 226R, 236R и 241R. Оказалось, что повышенная продукция андрогенов наблюдается при наличии всех полиморфных вариантов, кроме 216R и ассоциируется с повышением риска развития синдрома поликистозных яичников у женщин.
Ген AR
Кодирует рецептор андрогенов, связывает биологически активный андроген — дигидротестостерон. При связывании рецептора с дигидротестостероном включается цепь биохимических реакций, связанных с эффектами тестостерона в андрогензависимых тканях.
Ген AR расположен на Х-хромосоме и кодирует аминокислотную последовательность андрогенового рецептора (АР). Эти рецепторы содержатся в клетках семенников, простаты, кожи, нервов и других тканей и активизируются под действием мужского полового гормона тестостерона и дигидротестостерона, являющегося продуктом тестостерона, образующегося в результате тканевого метаболизма. АР опосредуют формирование мужских половых признаков, выработку сперматозоидов, кроме того, АР играют большую роль в процессе роста андрогенчувствительных опухолей. Наследование нарушений, связанных с полиморфизмом CAG-повторов, является Х-сцепленным и передается от матери сыну.